薬剤部は調剤室、薬品補給室、製剤室、薬品管理室、薬品情報室で構成され、それぞれのセクションが連携して、医薬品の適正使用に貢献するべく、業務を行っています。現在は2交代勤務体制を敷いており、365日・24時間切れ目なく薬剤業務を提供しています。また糖尿病教室、臨床薬学研修（大学院）、実務実習・早期体験学習（薬学部）、筑紫エリアの薬剤師勉強会などを通じて、患者さん、学生、薬剤師の教育にも力を注いでいます。さらに平成28年度より薬剤師レジデント制度を導入し、高度医療に対応できる臨床薬剤師の育成を行なっています。なお、当薬剤部には日本医療薬学会から委嘱を受けた指導薬剤師が在籍しており、様々な研修認定施設に指定されています。